Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Alyref2Q9JJW6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alyref2Q9JJW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alyref2Q9JJW6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alyref2Q9JJW6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alyref2Q9JJW6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alyref2Q9JJW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alyref2Q9JJW6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alyref2Q9JJW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alyref2Q9JJW6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Alyref2Q9JJW6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms