Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bco1Q9JJS6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bco1Q9JJS6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bco1Q9JJS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bco1Q9JJS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bco1Q9JJS6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bco1Q9JJS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bco1Q9JJS6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bco1Q9JJS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bco1Q9JJS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bco1Q9JJS6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bco1Q9JJS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bco1Q9JJS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco1Q9JJS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco1Q9JJS6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco1Q9JJS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bco1Q9JJS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bco1Q9JJS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bco1Q9JJS6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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