Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms