Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb9Q9JJ59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb9Q9JJ59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb9Q9JJ59 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb9Q9JJ59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb9Q9JJ59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Abcb9Q9JJ59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcb9Q9JJ59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcb9Q9JJ59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb9Q9JJ59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb9Q9JJ59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb9Q9JJ59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb9Q9JJ59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms