Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc40a1Q9JHI9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc40a1Q9JHI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc40a1Q9JHI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc40a1Q9JHI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slc40a1Q9JHI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc40a1Q9JHI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc40a1Q9JHI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc40a1Q9JHI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc40a1Q9JHI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc40a1Q9JHI9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc40a1Q9JHI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc40a1Q9JHI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc40a1Q9JHI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc40a1Q9JHI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc40a1Q9JHI9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc40a1Q9JHI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc40a1Q9JHI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc40a1Q9JHI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc40a1Q9JHI9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc40a1Q9JHI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc40a1Q9JHI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc40a1Q9JHI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc40a1Q9JHI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc40a1Q9JHI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc40a1Q9JHI9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc40a1Q9JHI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc40a1Q9JHI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc40a1Q9JHI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms