Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek6Q9ES70 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek6Q9ES70 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek6Q9ES70 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek6Q9ES70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nek6Q9ES70 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nek6Q9ES70 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nek6Q9ES70 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nek6Q9ES70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek6Q9ES70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek6Q9ES70 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek6Q9ES70 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek6Q9ES70 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek6Q9ES70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms