Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI5

Jmjd6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd6Q9ERI5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Jmjd6Q9ERI5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Jmjd6Q9ERI5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Jmjd6Q9ERI5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Jmjd6Q9ERI5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd6Q9ERI5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jmjd6Q9ERI5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jmjd6Q9ERI5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd6Q9ERI5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd6Q9ERI5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd6Q9ERI5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd6Q9ERI5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jmjd6Q9ERI5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jmjd6Q9ERI5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd6Q9ERI5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd6Q9ERI5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jmjd6Q9ERI5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jmjd6Q9ERI5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jmjd6Q9ERI5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Jmjd6Q9ERI5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Jmjd6Q9ERI5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Jmjd6Q9ERI5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd6Q9ERI5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Jmjd6Q9ERI5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd6Q9ERI5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms