Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aph1cQ9DCZ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Aph1cQ9DCZ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aph1cQ9DCZ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aph1cQ9DCZ9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aph1cQ9DCZ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aph1cQ9DCZ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aph1cQ9DCZ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aph1cQ9DCZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aph1cQ9DCZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aph1cQ9DCZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aph1cQ9DCZ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aph1cQ9DCZ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aph1cQ9DCZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.2 ms