Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc38a3Q9DCP2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc38a3Q9DCP2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc38a3Q9DCP2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc38a3Q9DCP2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc38a3Q9DCP2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc38a3Q9DCP2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc38a3Q9DCP2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc38a3Q9DCP2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc38a3Q9DCP2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc38a3Q9DCP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc38a3Q9DCP2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc38a3Q9DCP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc38a3Q9DCP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc38a3Q9DCP2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc38a3Q9DCP2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc38a3Q9DCP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc38a3Q9DCP2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc38a3Q9DCP2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc38a3Q9DCP2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc38a3Q9DCP2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc38a3Q9DCP2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc38a3Q9DCP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc38a3Q9DCP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc38a3Q9DCP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc38a3Q9DCP2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc38a3Q9DCP2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc38a3Q9DCP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc38a3Q9DCP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms