Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apbb2Q9DBR4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apbb2Q9DBR4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb2Q9DBR4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apbb2Q9DBR4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apbb2Q9DBR4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apbb2Q9DBR4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apbb2Q9DBR4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apbb2Q9DBR4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apbb2Q9DBR4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb2Q9DBR4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apbb2Q9DBR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apbb2Q9DBR4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apbb2Q9DBR4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Apbb2Q9DBR4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apbb2Q9DBR4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apbb2Q9DBR4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apbb2Q9DBR4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apbb2Q9DBR4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apbb2Q9DBR4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms