Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK9

Phpt1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phpt1Q9DAK9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phpt1Q9DAK9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phpt1Q9DAK9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phpt1Q9DAK9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Phpt1Q9DAK9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phpt1Q9DAK9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phpt1Q9DAK9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Phpt1Q9DAK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phpt1Q9DAK9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phpt1Q9DAK9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phpt1Q9DAK9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phpt1Q9DAK9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phpt1Q9DAK9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phpt1Q9DAK9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms