Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mrpl17Q9D8P4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mrpl17Q9D8P4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mrpl17Q9D8P4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mrpl17Q9D8P4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Mrpl17Q9D8P4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mrpl17Q9D8P4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrpl17Q9D8P4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mrpl17Q9D8P4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mrpl17Q9D8P4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrpl17Q9D8P4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrpl17Q9D8P4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrpl17Q9D8P4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mrpl17Q9D8P4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrpl17Q9D8P4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mrpl17Q9D8P4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mrpl17Q9D8P4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mrpl17Q9D8P4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mrpl17Q9D8P4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mrpl17Q9D8P4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mrpl17Q9D8P4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mrpl17Q9D8P4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Mrpl17Q9D8P4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mrpl17Q9D8P4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mrpl17Q9D8P4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mrpl17Q9D8P4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mrpl17Q9D8P4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mrpl17Q9D8P4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mrpl17Q9D8P4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mrpl17Q9D8P4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mrpl17Q9D8P4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mrpl17Q9D8P4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mrpl17Q9D8P4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms