Protein–RNA interactions for Protein: Q9D864

Actr6, Actin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr6Q9D864 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Actr6Q9D864 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Actr6Q9D864 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Actr6Q9D864 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Actr6Q9D864 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr6Q9D864 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Actr6Q9D864 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Actr6Q9D864 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actr6Q9D864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actr6Q9D864 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actr6Q9D864 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Actr6Q9D864 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actr6Q9D864 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actr6Q9D864 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms