Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Ccdc94Q9D6J3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Ccdc94Q9D6J3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Ccdc94Q9D6J3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Ccdc94Q9D6J3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc94Q9D6J3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Ccdc94Q9D6J3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ccdc94Q9D6J3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ccdc94Q9D6J3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ccdc94Q9D6J3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ccdc94Q9D6J3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Ccdc94Q9D6J3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Ccdc94Q9D6J3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ccdc94Q9D6J3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Ccdc94Q9D6J3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ccdc94Q9D6J3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Ccdc94Q9D6J3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ccdc94Q9D6J3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Ccdc94Q9D6J3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Ccdc94Q9D6J3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Ccdc94Q9D6J3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ccdc94Q9D6J3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Ccdc94Q9D6J3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms