Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb4aQ9D6F9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubb4aQ9D6F9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb4aQ9D6F9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb4aQ9D6F9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb4aQ9D6F9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb4aQ9D6F9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb4aQ9D6F9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb4aQ9D6F9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubb4aQ9D6F9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubb4aQ9D6F9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb4aQ9D6F9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tubb4aQ9D6F9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tubb4aQ9D6F9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tubb4aQ9D6F9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tubb4aQ9D6F9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tubb4aQ9D6F9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tubb4aQ9D6F9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tubb4aQ9D6F9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tubb4aQ9D6F9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tubb4aQ9D6F9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb4aQ9D6F9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms