Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ribc2Q9D4Q1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ribc2Q9D4Q1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ribc2Q9D4Q1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ribc2Q9D4Q1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ribc2Q9D4Q1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ribc2Q9D4Q1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ribc2Q9D4Q1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ribc2Q9D4Q1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ribc2Q9D4Q1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ribc2Q9D4Q1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ribc2Q9D4Q1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ribc2Q9D4Q1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ribc2Q9D4Q1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc2Q9D4Q1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ribc2Q9D4Q1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc2Q9D4Q1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms