Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B2

Ttc25, Tetratricopeptide repeat protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc25Q9D4B2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc25Q9D4B2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc25Q9D4B2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc25Q9D4B2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc25Q9D4B2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc25Q9D4B2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc25Q9D4B2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc25Q9D4B2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc25Q9D4B2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttc25Q9D4B2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc25Q9D4B2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc25Q9D4B2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc25Q9D4B2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc25Q9D4B2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc25Q9D4B2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc25Q9D4B2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc25Q9D4B2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc25Q9D4B2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms