Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd39Q9D2X0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd39Q9D2X0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd39Q9D2X0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ankrd39Q9D2X0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ankrd39Q9D2X0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ankrd39Q9D2X0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd39Q9D2X0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd39Q9D2X0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms