Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bcas2Q9D287 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas2Q9D287 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bcas2Q9D287 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcas2Q9D287 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcas2Q9D287 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcas2Q9D287 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcas2Q9D287 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bcas2Q9D287 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bcas2Q9D287 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcas2Q9D287 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcas2Q9D287 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcas2Q9D287 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bcas2Q9D287 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bcas2Q9D287 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcas2Q9D287 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcas2Q9D287 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcas2Q9D287 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcas2Q9D287 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcas2Q9D287 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcas2Q9D287 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcas2Q9D287 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcas2Q9D287 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms