Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lingo1Q9D1T0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lingo1Q9D1T0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lingo1Q9D1T0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lingo1Q9D1T0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lingo1Q9D1T0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lingo1Q9D1T0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lingo1Q9D1T0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lingo1Q9D1T0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo1Q9D1T0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lingo1Q9D1T0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lingo1Q9D1T0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lingo1Q9D1T0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo1Q9D1T0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lingo1Q9D1T0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lingo1Q9D1T0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lingo1Q9D1T0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lingo1Q9D1T0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lingo1Q9D1T0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lingo1Q9D1T0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lingo1Q9D1T0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lingo1Q9D1T0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lingo1Q9D1T0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lingo1Q9D1T0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lingo1Q9D1T0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lingo1Q9D1T0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lingo1Q9D1T0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lingo1Q9D1T0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms