Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl28Q9D1B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrpl28Q9D1B9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrpl28Q9D1B9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mrpl28Q9D1B9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mrpl28Q9D1B9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mrpl28Q9D1B9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl28Q9D1B9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mrpl28Q9D1B9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms