Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrpl52Q9D0Y8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl52Q9D0Y8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl52Q9D0Y8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl52Q9D0Y8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl52Q9D0Y8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms