Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp11Q9CZJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Utp11Q9CZJ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Utp11Q9CZJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Utp11Q9CZJ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Utp11Q9CZJ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Utp11Q9CZJ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Utp11Q9CZJ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Utp11Q9CZJ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Utp11Q9CZJ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Utp11Q9CZJ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Utp11Q9CZJ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Utp11Q9CZJ1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Utp11Q9CZJ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Utp11Q9CZJ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp11Q9CZJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms