Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim13Q9CYB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim13Q9CYB0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim13Q9CYB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim13Q9CYB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim13Q9CYB0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim13Q9CYB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim13Q9CYB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim13Q9CYB0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim13Q9CYB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim13Q9CYB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim13Q9CYB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms