Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mgme1Q9CXC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mgme1Q9CXC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mgme1Q9CXC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mgme1Q9CXC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mgme1Q9CXC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mgme1Q9CXC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mgme1Q9CXC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mgme1Q9CXC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mgme1Q9CXC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mgme1Q9CXC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mgme1Q9CXC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mgme1Q9CXC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mgme1Q9CXC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mgme1Q9CXC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mgme1Q9CXC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mgme1Q9CXC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms