Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD3

Nudt17, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 17, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt17Q9CWD3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nudt17Q9CWD3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nudt17Q9CWD3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nudt17Q9CWD3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nudt17Q9CWD3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nudt17Q9CWD3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nudt17Q9CWD3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nudt17Q9CWD3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nudt17Q9CWD3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nudt17Q9CWD3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nudt17Q9CWD3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nudt17Q9CWD3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nudt17Q9CWD3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nudt17Q9CWD3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nudt17Q9CWD3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nudt17Q9CWD3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nudt17Q9CWD3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nudt17Q9CWD3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nudt17Q9CWD3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudt17Q9CWD3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudt17Q9CWD3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nudt17Q9CWD3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudt17Q9CWD3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudt17Q9CWD3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms