Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Fgfr1op2Q9CRA9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Fgfr1op2Q9CRA9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Fgfr1op2Q9CRA9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Fgfr1op2Q9CRA9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Fgfr1op2Q9CRA9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,72
Fgfr1op2Q9CRA9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Fgfr1op2Q9CRA9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Fgfr1op2Q9CRA9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Fgfr1op2Q9CRA9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Fgfr1op2Q9CRA9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Fgfr1op2Q9CRA9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Fgfr1op2Q9CRA9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Fgfr1op2Q9CRA9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms