Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR24

Nudt8, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 8, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt8Q9CR24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nudt8Q9CR24 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nudt8Q9CR24 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nudt8Q9CR24 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nudt8Q9CR24 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nudt8Q9CR24 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nudt8Q9CR24 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nudt8Q9CR24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nudt8Q9CR24 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nudt8Q9CR24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nudt8Q9CR24 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nudt8Q9CR24 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nudt8Q9CR24 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nudt8Q9CR24 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nudt8Q9CR24 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nudt8Q9CR24 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nudt8Q9CR24 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nudt8Q9CR24 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nudt8Q9CR24 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nudt8Q9CR24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nudt8Q9CR24 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nudt8Q9CR24 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nudt8Q9CR24 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nudt8Q9CR24 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nudt8Q9CR24 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nudt8Q9CR24 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nudt8Q9CR24 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nudt8Q9CR24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nudt8Q9CR24 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nudt8Q9CR24 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nudt8Q9CR24 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nudt8Q9CR24 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nudt8Q9CR24 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nudt8Q9CR24 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nudt8Q9CR24 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms