Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr3kQ9CQZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr3kQ9CQZ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Polr3kQ9CQZ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr3kQ9CQZ7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr3kQ9CQZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr3kQ9CQZ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr3kQ9CQZ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr3kQ9CQZ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr3kQ9CQZ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Polr3kQ9CQZ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Polr3kQ9CQZ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Polr3kQ9CQZ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms