Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med30Q9CQI9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med30Q9CQI9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med30Q9CQI9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Med30Q9CQI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med30Q9CQI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med30Q9CQI9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med30Q9CQI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med30Q9CQI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med30Q9CQI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med30Q9CQI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med30Q9CQI9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms