Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TpbpbQ9CQC0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TpbpbQ9CQC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TpbpbQ9CQC0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TpbpbQ9CQC0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TpbpbQ9CQC0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TpbpbQ9CQC0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TpbpbQ9CQC0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TpbpbQ9CQC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TpbpbQ9CQC0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TpbpbQ9CQC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms