Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nudcd2Q9CQ48 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nudcd2Q9CQ48 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nudcd2Q9CQ48 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nudcd2Q9CQ48 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nudcd2Q9CQ48 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nudcd2Q9CQ48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nudcd2Q9CQ48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nudcd2Q9CQ48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nudcd2Q9CQ48 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd2Q9CQ48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nudcd2Q9CQ48 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd2Q9CQ48 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nudcd2Q9CQ48 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms