Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,39■■□□□ 1,82
StambpQ9CQ26 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
StambpQ9CQ26 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
StambpQ9CQ26 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
StambpQ9CQ26 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
StambpQ9CQ26 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
StambpQ9CQ26 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,31■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,27■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
StambpQ9CQ26 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,25■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,2■■□□□ 1,79
StambpQ9CQ26 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
StambpQ9CQ26 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
StambpQ9CQ26 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
StambpQ9CQ26 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
StambpQ9CQ26 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
StambpQ9CQ26 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
StambpQ9CQ26 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
StambpQ9CQ26 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
StambpQ9CQ26 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
StambpQ9CQ26 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
StambpQ9CQ26 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
StambpQ9CQ26 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
StambpQ9CQ26 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
StambpQ9CQ26 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,63■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
StambpQ9CQ26 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,1 ms