Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
StambpQ9CQ26 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
StambpQ9CQ26 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
StambpQ9CQ26 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
StambpQ9CQ26 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
StambpQ9CQ26 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
StambpQ9CQ26 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
StambpQ9CQ26 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
StambpQ9CQ26 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
StambpQ9CQ26 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
StambpQ9CQ26 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
StambpQ9CQ26 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
StambpQ9CQ26 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
StambpQ9CQ26 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
StambpQ9CQ26 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
StambpQ9CQ26 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
StambpQ9CQ26 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
StambpQ9CQ26 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
StambpQ9CQ26 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
StambpQ9CQ26 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
StambpQ9CQ26 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
StambpQ9CQ26 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
StambpQ9CQ26 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
StambpQ9CQ26 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
StambpQ9CQ26 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
StambpQ9CQ26 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
StambpQ9CQ26 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms