Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ22

Lamtor1, Ragulator complex protein LAMTOR1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamtor1Q9CQ22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamtor1Q9CQ22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lamtor1Q9CQ22 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamtor1Q9CQ22 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamtor1Q9CQ22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamtor1Q9CQ22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamtor1Q9CQ22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamtor1Q9CQ22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamtor1Q9CQ22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lamtor1Q9CQ22 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamtor1Q9CQ22 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamtor1Q9CQ22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamtor1Q9CQ22 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lamtor1Q9CQ22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms