Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ms4a4dQ99N05 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ms4a4dQ99N05 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a4dQ99N05 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a4dQ99N05 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ms4a4dQ99N05 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a4dQ99N05 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a4dQ99N05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a4dQ99N05 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a4dQ99N05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a4dQ99N05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a4dQ99N05 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a4dQ99N05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a4dQ99N05 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms