Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rassf1Q99MK9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rassf1Q99MK9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rassf1Q99MK9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rassf1Q99MK9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rassf1Q99MK9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rassf1Q99MK9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rassf1Q99MK9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rassf1Q99MK9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf1Q99MK9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rassf1Q99MK9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rassf1Q99MK9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms