Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abtb1Q99LJ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abtb1Q99LJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abtb1Q99LJ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abtb1Q99LJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Abtb1Q99LJ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abtb1Q99LJ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abtb1Q99LJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abtb1Q99LJ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abtb1Q99LJ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abtb1Q99LJ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abtb1Q99LJ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abtb1Q99LJ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abtb1Q99LJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abtb1Q99LJ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abtb1Q99LJ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abtb1Q99LJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abtb1Q99LJ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abtb1Q99LJ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abtb1Q99LJ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abtb1Q99LJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Abtb1Q99LJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Abtb1Q99LJ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Abtb1Q99LJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Abtb1Q99LJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abtb1Q99LJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abtb1Q99LJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abtb1Q99LJ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abtb1Q99LJ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abtb1Q99LJ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abtb1Q99LJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms