Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ufsp2Q99K23 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ufsp2Q99K23 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufsp2Q99K23 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufsp2Q99K23 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufsp2Q99K23 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufsp2Q99K23 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufsp2Q99K23 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufsp2Q99K23 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufsp2Q99K23 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufsp2Q99K23 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ufsp2Q99K23 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ufsp2Q99K23 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ufsp2Q99K23 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ufsp2Q99K23 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.7 ms