Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1bQ99JY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1bQ99JY6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1bQ99JY6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Higd1bQ99JY6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1bQ99JY6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Higd1bQ99JY6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Higd1bQ99JY6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Higd1bQ99JY6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Higd1bQ99JY6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Higd1bQ99JY6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Higd1bQ99JY6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Higd1bQ99JY6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Higd1bQ99JY6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Higd1bQ99JY6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms