Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfxn4Q925N1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sfxn4Q925N1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfxn4Q925N1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfxn4Q925N1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfxn4Q925N1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfxn4Q925N1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sfxn4Q925N1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sfxn4Q925N1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfxn4Q925N1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfxn4Q925N1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfxn4Q925N1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfxn4Q925N1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms