Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR5

Catsper1, Cation channel sperm-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper1Q91ZR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Catsper1Q91ZR5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Catsper1Q91ZR5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Catsper1Q91ZR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Catsper1Q91ZR5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Catsper1Q91ZR5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Catsper1Q91ZR5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Catsper1Q91ZR5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Catsper1Q91ZR5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Catsper1Q91ZR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Catsper1Q91ZR5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Catsper1Q91ZR5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Catsper1Q91ZR5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Catsper1Q91ZR5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Catsper1Q91ZR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms