Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NifkQ91VE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NifkQ91VE6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NifkQ91VE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NifkQ91VE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NifkQ91VE6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NifkQ91VE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NifkQ91VE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NifkQ91VE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NifkQ91VE6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NifkQ91VE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NifkQ91VE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NifkQ91VE6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NifkQ91VE6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NifkQ91VE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NifkQ91VE6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms