Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bles03Q8VD62 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bles03Q8VD62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bles03Q8VD62 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bles03Q8VD62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bles03Q8VD62 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bles03Q8VD62 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bles03Q8VD62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bles03Q8VD62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bles03Q8VD62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bles03Q8VD62 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bles03Q8VD62 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bles03Q8VD62 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bles03Q8VD62 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bles03Q8VD62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms