Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F6

Ilkap, Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkapQ8R0F6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IlkapQ8R0F6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IlkapQ8R0F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IlkapQ8R0F6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IlkapQ8R0F6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IlkapQ8R0F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IlkapQ8R0F6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IlkapQ8R0F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IlkapQ8R0F6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkapQ8R0F6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IlkapQ8R0F6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IlkapQ8R0F6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IlkapQ8R0F6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IlkapQ8R0F6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IlkapQ8R0F6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IlkapQ8R0F6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IlkapQ8R0F6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IlkapQ8R0F6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IlkapQ8R0F6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms