Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defb12Q8K4N3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defb12Q8K4N3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defb12Q8K4N3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defb12Q8K4N3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defb12Q8K4N3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defb12Q8K4N3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defb12Q8K4N3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defb12Q8K4N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defb12Q8K4N3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms