Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfip2Q8K221 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfip2Q8K221 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arfip2Q8K221 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arfip2Q8K221 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arfip2Q8K221 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Arfip2Q8K221 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arfip2Q8K221 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfip2Q8K221 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfip2Q8K221 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arfip2Q8K221 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arfip2Q8K221 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arfip2Q8K221 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfip2Q8K221 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfip2Q8K221 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfip2Q8K221 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfip2Q8K221 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfip2Q8K221 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfip2Q8K221 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfip2Q8K221 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfip2Q8K221 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfip2Q8K221 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfip2Q8K221 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Arfip2Q8K221 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Arfip2Q8K221 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arfip2Q8K221 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms