Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cpne5Q8JZW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne5Q8JZW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpne5Q8JZW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpne5Q8JZW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne5Q8JZW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne5Q8JZW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpne5Q8JZW4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne5Q8JZW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne5Q8JZW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne5Q8JZW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne5Q8JZW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne5Q8JZW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpne5Q8JZW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne5Q8JZW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne5Q8JZW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne5Q8JZW4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne5Q8JZW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpne5Q8JZW4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cpne5Q8JZW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne5Q8JZW4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cpne5Q8JZW4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpne5Q8JZW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne5Q8JZW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne5Q8JZW4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpne5Q8JZW4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms