Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHQ0

Fbxo4, F-box only protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo4Q8CHQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo4Q8CHQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo4Q8CHQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo4Q8CHQ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo4Q8CHQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo4Q8CHQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo4Q8CHQ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxo4Q8CHQ0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbxo4Q8CHQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo4Q8CHQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbxo4Q8CHQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbxo4Q8CHQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo4Q8CHQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo4Q8CHQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo4Q8CHQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo4Q8CHQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo4Q8CHQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo4Q8CHQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo4Q8CHQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo4Q8CHQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo4Q8CHQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo4Q8CHQ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo4Q8CHQ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo4Q8CHQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fbxo4Q8CHQ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fbxo4Q8CHQ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fbxo4Q8CHQ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo4Q8CHQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo4Q8CHQ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms