Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap29Q8CGF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Arhgap29Q8CGF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arhgap29Q8CGF1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgap29Q8CGF1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgap29Q8CGF1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Arhgap29Q8CGF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap29Q8CGF1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arhgap29Q8CGF1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Arhgap29Q8CGF1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Arhgap29Q8CGF1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arhgap29Q8CGF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arhgap29Q8CGF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Arhgap29Q8CGF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arhgap29Q8CGF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap29Q8CGF1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arhgap29Q8CGF1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arhgap29Q8CGF1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Arhgap29Q8CGF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgap29Q8CGF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgap29Q8CGF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms