Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ5

Slc22a12, Solute carrier family 22 member 12, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a12Q8CFZ5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc22a12Q8CFZ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc22a12Q8CFZ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a12Q8CFZ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a12Q8CFZ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc22a12Q8CFZ5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc22a12Q8CFZ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc22a12Q8CFZ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc22a12Q8CFZ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc22a12Q8CFZ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc22a12Q8CFZ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc22a12Q8CFZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc22a12Q8CFZ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc22a12Q8CFZ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc22a12Q8CFZ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc22a12Q8CFZ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc22a12Q8CFZ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc22a12Q8CFZ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc22a12Q8CFZ5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a12Q8CFZ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a12Q8CFZ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc22a12Q8CFZ5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms