Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CntrobQ8CB62 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CntrobQ8CB62 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CntrobQ8CB62 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CntrobQ8CB62 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CntrobQ8CB62 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CntrobQ8CB62 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CntrobQ8CB62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CntrobQ8CB62 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CntrobQ8CB62 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CntrobQ8CB62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CntrobQ8CB62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CntrobQ8CB62 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CntrobQ8CB62 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CntrobQ8CB62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CntrobQ8CB62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CntrobQ8CB62 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CntrobQ8CB62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CntrobQ8CB62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
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